Taxonomie bactérienne

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  Généralités

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      présentation de l'auteur

      Dr GHLIS DAHMANI Bouchra

      Département : biologie 

      Faculté : Sciences de la nature et de la Vie

      Université:  Djilali Bounaama Khemis Miliana 

      Email: bouchra.dahmani@univ-dbkm.dz
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      Informations sur le cours

      -Crédit : 03
      -Coefficient : 03
      -Durée : 15 semaines (30h CM + 15h TD)
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      Objectifs du cours

      À la fin du cours, l'étudiant(e) sera capable de :
      -Définir les concepts fondamentaux de la taxonomie, de la systématique et de la
      nomenclature bactérienne.
      Décrire les différents niveaux hiérarchiques de la classification biologique (du domaine
      à l'espèce).
      Expliquer les critères utilisés dans l'identification et la classification des bactéries :
      morphologiques, biochimiques, génétiques et phylogénétiques.
      Utiliser des clés d'identification bactérienne et des bases de données taxonomiques (ex. :
      Bergey's Manual, LPSN).
      Appliquer les techniques d'identification bactérienne en travaux pratiques : coloration
      de Gram, galerie API, PCR, séquençage 16S rRNA.
      Interpréter les résultats d'une analyse phylogénétique pour positionner une bactérie dans
      un arbre évolutif.
      Reconnaître l'importance de la taxonomie dans les domaines de la microbiologie
      médicale, environnementale et industrielle
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      les pré-requis

      • Microbiologie générale
      • Bases en génétique et biologie moléculaire
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    test des pré-requis
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  Eléments de contenu

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• Sélectionner la section Chapitre 1: Introduction a la systématique

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  Chapitre 1: Introduction a la systématique

  À la fin de ce chapitre, l’étudiant(e) doit être capable de :

  1. Définir la taxonomie et distinguer ses trois composantes : classification, nomenclature et identification.

  2. Expliquer les caractéristiques des procaryotes et différencier les deux domaines : Bacteria et Archaea.

  3. Décrire les principaux rangs taxonomiques (espèce, genre, famille, ordre, classe, phylum) et leurs suffixes caractéristiques.

  4. Expliquer les différents variants infraspécifiques (biovars, morphovars, sérovars, pathovars, etc.).

  5. Comparer les approches taxonomiques : phénotypique, moléculaire, polyphasique.

  6. Décrire les types de classification (artificielle, naturelle, Bergey’s Manual).

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  • Sélectionner l’activité test pour le premier chapitre

    

    test pour le premier chapitre

    Ouvert : dimanche 24 août 2025, 08:18

    Se termine : lundi 24 août 2026, 08:18
• Sélectionner la section Chapitre 2: Etudes des différents groupes bactériens et archaeéns

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  Chapitre 2: Etudes des différents groupes bactériens et archaeéns

  • Sélectionner l’activité chapitre 2

    

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• Sélectionner la section Chapitre 3: Les grands phylums bactérien selon la classification du Bergey's Manual : biologie, taxonomie, morphologie et écologie

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  Chapitre 3: Les grands phylums bactérien selon la classification du Bergey's Manual : biologie, taxonomie, morphologie et écologie

  • Sélectionner l’activité Chapitre 3

    

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• Sélectionner la section chapitre 4: Les cinq Phyla d’Archaea

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  chapitre 4: Les cinq Phyla d’Archaea

  • Sélectionner l’activité chapitre 4

    

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• Sélectionner la section travaux pratiques

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  travaux pratiques

  • Sélectionner l’activité tp n° 1: Les entérobactéries : Coloration de Gram, Tests physiologiques ( type respiratoire, Nitrate réductase, catalase, oxydase, Métabolisme des glucides sur Galerie API

    

    tp n° 1: Les entérobactéries : Coloration de Gram, Tests physiologiques ( type respiratoire, Nitrate réductase, catalase, oxydase, Métabolisme des glucides sur Galerie API Fichier
  • Sélectionner l’activité TP n°2 : Les bactéries en forme de cocci a Gram positif : Coloration de Gram, Test physiologiques différentiels entre Streptocoques et Staphylocoques, Test présomptifs et confirmatifs de pathogénicité, Test de la staphylocoagulase.

    

    TP n°2 : Les bactéries en forme de cocci a Gram positif : Coloration de Gram, Test physiologiques différentiels entre Streptocoques et Staphylocoques, Test présomptifs et confirmatifs de pathogénicité, Test de la staphylocoagulase. Fichier
  • Sélectionner l’activité TP n° 3 : les bactéries a Gram négatif : Coloration de Gram, Tests physiologiques ( type respiratoire, Nitrate réductase, catalase, oxydase, Métabolisme des glucides sur Galerie API.

    

    TP n° 3 : les bactéries a Gram négatif : Coloration de Gram, Tests physiologiques ( type respiratoire, Nitrate réductase, catalase, oxydase, Métabolisme des glucides sur Galerie API. Fichier
  • Sélectionner l’activité TP n° 4 : Les autres Bactéries à Gram négatif (Pseudomonas, vibrio…) : antibiorésistance.

    

    TP n° 4 : Les autres Bactéries à Gram négatif (Pseudomonas, vibrio…) : antibiorésistance. Fichier
• Sélectionner la section Références

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  Références

  • Sélectionner l’activité Références bibliographique

    

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• Sélectionner la section examen final

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  examen final

  

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    examen final Test

    Ouvert : mercredi 30 juillet 2025, 00:40

    Se termine : dimanche 31 août 2025, 00:40