Course: Taxonomie bactérienne

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  présentation de l'auteur
  
  Dr GHLIS DAHMANI Bouchra
  
  Département : biologie
  
  Faculté : Sciences de la nature et de la Vie
  
  Université: Djilali Bounaama Khemis Miliana
  
  Email: bouchra.dahmani@univ-dbkm.dz
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  Informations sur le cours
  
  -Crédit : 03
  -Coefficient : 03
  -Durée : 15 semaines (30h CM + 15h TD)
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  Objectifs du cours
  
  À la fin du cours, l'étudiant(e) sera capable de :
  -Définir les concepts fondamentaux de la taxonomie, de la systématique et de la
  nomenclature bactérienne.
  Décrire les différents niveaux hiérarchiques de la classification biologique (du domaine
  à l'espèce).
  Expliquer les critères utilisés dans l'identification et la classification des bactéries :
  morphologiques, biochimiques, génétiques et phylogénétiques.
  Utiliser des clés d'identification bactérienne et des bases de données taxonomiques (ex. :
  Bergey's Manual, LPSN).
  Appliquer les techniques d'identification bactérienne en travaux pratiques : coloration
  de Gram, galerie API, PCR, séquençage 16S rRNA.
  Interpréter les résultats d'une analyse phylogénétique pour positionner une bactérie dans
  un arbre évolutif.
  Reconnaître l'importance de la taxonomie dans les domaines de la microbiologie
  médicale, environnementale et industrielle
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  les pré-requis
  
  Microbiologie générale
  
  Bases en génétique et biologie moléculaire
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  test des pré-requis Quiz
Select section Eléments de contenu

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Eléments de contenu
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  Eléments de contenu File
Select section Chapitre 1: Introduction a la systématique

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Chapitre 1: Introduction a la systématique
À la fin de ce chapitre, l’étudiant(e) doit être capable de :

Définir la taxonomie et distinguer ses trois composantes : classification, nomenclature et identification.

Expliquer les caractéristiques des procaryotes et différencier les deux domaines : Bacteria et Archaea.

Décrire les principaux rangs taxonomiques (espèce, genre, famille, ordre, classe, phylum) et leurs suffixes caractéristiques.

Expliquer les différents variants infraspécifiques (biovars, morphovars, sérovars, pathovars, etc.).

Comparer les approches taxonomiques : phénotypique, moléculaire, polyphasique.

Décrire les types de classification (artificielle, naturelle, Bergey’s Manual).
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  Cette vidéo vous aidera à mieux assimiler les notions abordées.
- Select activity test pour le premier chapitre
  
  test pour le premier chapitre Quiz
  
  Opened: Sunday, 24 August 2025, 8:18 AM
  
  Closes: Monday, 24 August 2026, 8:18 AM
Select section Chapitre 2: Etudes des différents groupes bactériens et archaeéns

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Chapitre 2: Etudes des différents groupes bactériens et archaeéns
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  chapitre 2 File
Select section Chapitre 3: Les grands phylums bactérien selon la classification du Bergey's Manual : biologie, taxonomie, morphologie et écologie

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Chapitre 3: Les grands phylums bactérien selon la classification du Bergey's Manual : biologie, taxonomie, morphologie et écologie
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  Chapitre 3 File
Select section chapitre 4: Les cinq Phyla d’Archaea

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chapitre 4: Les cinq Phyla d’Archaea
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Select section travaux pratiques

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travaux pratiques
- Select activity tp n° 1: Les entérobactéries : Coloration de Gram, Tests physiologiques ( type respiratoire, Nitrate réductase, catalase, oxydase, Métabolisme des glucides sur Galerie API
  
  tp n° 1: Les entérobactéries : Coloration de Gram, Tests physiologiques ( type respiratoire, Nitrate réductase, catalase, oxydase, Métabolisme des glucides sur Galerie API File
- Select activity TP n°2 : Les bactéries en forme de cocci a Gram positif : Coloration de Gram, Test physiologiques différentiels entre Streptocoques et Staphylocoques, Test présomptifs et confirmatifs de pathogénicité, Test de la staphylocoagulase.
  
  TP n°2 : Les bactéries en forme de cocci a Gram positif : Coloration de Gram, Test physiologiques différentiels entre Streptocoques et Staphylocoques, Test présomptifs et confirmatifs de pathogénicité, Test de la staphylocoagulase. File
- Select activity TP n° 3 : les bactéries a Gram négatif : Coloration de Gram, Tests physiologiques ( type respiratoire, Nitrate réductase, catalase, oxydase, Métabolisme des glucides sur Galerie API.
  
  TP n° 3 : les bactéries a Gram négatif : Coloration de Gram, Tests physiologiques ( type respiratoire, Nitrate réductase, catalase, oxydase, Métabolisme des glucides sur Galerie API. File
- Select activity TP n° 4 : Les autres Bactéries à Gram négatif (Pseudomonas, vibrio…) : antibiorésistance.
  
  TP n° 4 : Les autres Bactéries à Gram négatif (Pseudomonas, vibrio…) : antibiorésistance. File
Select section Références

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Références
- Select activity Références bibliographique
  
  Références bibliographique File
Select section examen final

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examen final
- Select activity examen final
  
  examen final Quiz
  
  Opened: Wednesday, 30 July 2025, 12:40 AM
  
  Closes: Sunday, 31 August 2025, 12:40 AM